Publications
29th Symposium on Environmental Chemistry Royal Society of Chemistry Award (2021)
Estimating susceptibility of rodenticide by molecular dynamics & machine learning using 3D structure of vitamin K epoxide reductase
Author
Kazuki Takeda, Nobuaki Yasuo, Kanami Watanabe, Ryo Sato, Ryo Kamata, Masakazu Sekijima
Category
Domestic conference
Abstract
ワルファリンなど抗血液凝固剤は医薬品・殺鼠剤として広く用いられている。この標的分子ビタミン K エポキシド還元酵素(VKOR)の遺伝子多型(種差・個人差)は殺鼠剤耐性/中毒の原因となっている。本研究では VKOR と殺鼠剤の立体構造を用いた分子動力学シミュレーションと機械学習による多変量データの解析により、VKOR 遺伝子多型から殺鼠剤感受性を評価する手法の構築を試みた。