Publications
The 4th Spring Meeting of the Japanese Society of Comparative Pharmacology and Toxicology (2022)
Functional analysis of splicing variant 2 of blood coagulation factor IX
Author
Kanami Watanabe, Ryo Sato, Ryo Kamata, and Kazuki Takeda
Category
Domestic conference
Abstract
血液凝固第IX因子(FIX)はビタミンK依存性タンパクである。NCBI GenBankにはFIXのスプライシングバリアントとしてバリアント1(FIX-V1)とEGFドメインを１つ欠くバリアント2(FIX-V2)の登録があるがFIX-V2の働きは不透明である。本研究ではバリアント2の機能解析として、培養細胞を使用した凝固活性試験と深層学習ベースの構造推定アルゴリズムAlphaFold2によるFIX-V2と関連因子との複合体モデリングを行なった。